百万级化合物库(中药、FDA、商业库)

DiffDock深度学习对接

AutoDock Vina经典对接

多靶点联合筛选

ADMET性质预测

常规MD模拟(100ns标准)

Amber力场优化

GROMACS高性能计算

高斯加速MD(微秒级)

自由能计算(MM/PBSA)

蛋白质三维结构预测

小分子-蛋白结合模式

蛋白-蛋白相互作用

多链复合物建模

突变体结构预测

成分-靶点网络构建

分子钓靶(Reverse Docking)

通路富集分析

疾病-基因关联分析

PPI网络分析

基于深度生成模型的分子设计

片段生长与骨架跃迁

基于靶点的分子生成

分子性质优化（ADMET友好）

开源工具集成(RDKit、DeepChem)

GaMD(高斯加速分子动力学)

微秒级长时间尺度模拟

药物解离/结合路径探索

蛋白构象变化研究

自由能景观绘制

分子结构渲染(PyMOL/ChimeraX)

动力学轨迹可视化

网络图谱绘制

统计图表优化(GraphPad风格)

出版级插图定制